La Confédération encourage un élevage qui tient encore plus compte des exigences des animaux de rente par le biais de trois programmes de bien-être animal :
- Systèmes de stabulation particulièrement respectueux des animaux (SST)
- Sorties régulières en plein air (SRPA)
- Contribution à la mise au pâturage
La participation à ces programmes éthologiques de la Confédération est par contre facultative. Chaque agriculteur, chaque agricultrice peut choisir à quel programme et pour quelles catégories d'animaux il ou elle participe.
Une meilleure prise en compte des exigences des animaux nécessite des prestations supplémentaires correspondantes de la part des agriculteurs et des agricultrices :
- Concernant le programme SST, ce sont les coûts élevés dus par exemple aux dimensions plus importantes des surfaces de stabulation, ainsi que le surcroît de travail et les dépenses plus élevées en matériel, en particulier pour la litière.
- Pour le programme SRPA, les prestations supplémentaires sont surtout engendrées par un surcroît de travail, notamment pour conduire les animaux au pâturage et pour le retour, pour clôturer les pâturages et entretenir ces derniers.
- Par rapport aux exigences SRPA, la contribution à la mise au pâturage est soumise à des exigences particulièrement élevées en ce qui concerne la part de sorties et de pâturage. Par conséquent, la charge de travail est encore plus élevée. Toutes les catégories de bovins peuvent être inscrites.
Les prestations supplémentaires fournies par les agriculteurs sont compensées par la Confédération sous forme de contributions SST (depuis 1996), de contributions SRPA (depuis 1993) et de contribution de mise au pâturage (depuis 2023). En outre, les denrées alimentaires produites de manière particulièrement respectueuse des animaux devraient pouvoir être vendues à un prix plus élevé. Les exigences du programme SRPA constituent la base de l'élevage en agriculture biologique en Suisse. De plus, différents programmes de label de droit privé se basent sur les programmes de bien-être animal.