Les organismes de quarantaine sont des maladies des végétaux ou des ravageurs susceptibles d’avoir un impact économique, qui ne sont pas présents en Suisse ou ne le sont que localement. Ils doivent être impérativement annoncés et combattus. Pour qu’un pays puisse réglementer un organisme nuisible en tant qu’organisme de quarantaine, il faut procéder à une analyse du risque selon des normes internationales et des critères spécifiques doivent être remplis. Il doit par exemple exister des mesures réalisables et efficaces qui permettent d’empêcher l’introduction et la dissémination de l’organisme et de réduire les dommages qu’il cause.
En Suisse, les organismes de quarantaine sont réglementés dans l’annexe 1 de l’ordonnance du DEFR et du DETEC relative à l’ordonnance sur la santé des végétaux (OSaVé-DEFR-DETEC, RS 916.201).